O objetivo do Ensino Médio é assegurar ao estudante o aprofundamento dos estudos em todas as áreas do conhecimento, qualificando-o para sua formação acadêmica integral, preparando-os para o sucesso na realização do ENEM e para maratona dos vestibulares.

O preparo do aluno acontece desde a 1ª série do Ensino Médio e se intensifica na 3ª série.

No Colégio Van Gogh o Ensino Médio é desenvolvido em 2 anos e meio, sendo que no 2º semestre do 3º ano funciona como cursinho semi-extensivo, desenvolvendo as matérias no nível exigido pelos exames do ENEM e vestibulares.